Auswertung und Visulisierung Fragmentlängenanalyseinformationen
GenoProof Mixture bietet mit der neuen EasyRead-Technologie eine neue Generation für die Auswertung von Daten aus der Fragmentlängenanalyse. Diese ermöglicht eine schnelle und robuste Auswertung Ihrer Daten von der Analyseplattform (FSA/HID) im Hochdurchsatz. Auch Spuren im Low-Template-Bereich können ohne aufwendige Anpassung der Auswertemethode zuverlässig und unabhängig von der eingesetzten Analyseplattform ausgewertet werden. Die EasyRead-Technologie unterstützt aktuell bis zu 6-Farben im Testkit. Für die biostatistische Spurenbewertung mit Hilfe des vollständig kontinuierlichen Modells liefern wir eine bereits konfigurierte Auswertemethode EasyRead (LRfc) mit.
Size und Allel Calling
Für eine unkomplizierte und schnelle Analyse wurden die Size- und Allel Calling Algorithmen für die Auswertung von Fragmentlängeninformationen um eine automatische Peakerkennung mittels Polynomfunktion ergänzt. Des Weiteren wird die Größenzuweisung durch eine umfangreiche Mustererkennung unterstützt. Diese Verbesserungen ermöglichen eine effiziente Hochdurchsatzanalyse.
Referenzdaten
GenoProof Mixture unterstützt die automatische Analyse von autosomalen und gonosomalen Markern mittels kommerzieller Multiplex-Kits sowie mit In-house Multiplex-Kits. Die Basis dafür bildet eine umfangreiche Referenzdatenbank bestehend aus allen bekannten, kommerziell erhältlichen STR-Kits, Längenstandards und Markern. Zusätzlich kann dieser Datenbestand einfach und schnell ergänzt und erweitert werden.
Grafische Benutzeroberfläche
Die Rohdaten werden in einer speziellen grafischen Benutzeroberfläche dargestellt, die extra für die Anzeige und Bearbeitung vom Elektropherogrammen entwickelt wurde. Neben einer punktgenauen Darstellung sowie umfangreichen Zoom-Funktionen bietet die Oberfläche auch viele Möglichkeiten für die Bearbeitung und Auswertung von Spuren. Dazu gehört auch die freie Anordnung mehrerer Fenster neben- oder übereinander, so dass mehrere Spuren direkt verglichen werden können. Für eine vereinfachte Analyse mehrerer Replikate wurde die Möglichkeit einer markerzentrischen Ansicht implementiert.
Artefakterkennung
GenoProof Mixture unterstützt eine vollständige Auswertung von Informationen aus der Fragmentlängenanalyse mit Hilfe von hochentwickelten Algorithmen zur Identifizierung von Artefakten wie Stutter-Peaks, Shoulder-Peaks, Off-Ladder-Peaks und Off-Scale-Peaks und Pull-Up-Peaks. Die Artefakterkennung erfolgt automatisch während des Size- und Allel Callings und kann vom Anwender angepasst werden.