Rohdatenauswertung

GenoProof Mixture 3 bietet mit der neuen EasyRead-Technologie eine neue Generation der Rohdatenanalyse. Diese ermöglicht eine schnelle und robuste Rohdatenanalyse (FSA/HID) im Hochdurchsatz sowohl für die Auswertung von Referenzproben als auch für Mischspuren. Nicht nur high-quality-Proben, sondern auch Spuren im Low-Template-Bereich können ohne aufwendige Anpassung der Auswertemethode zuverlässig ausgewertet werden. Die EasyRead-Technologie unterstützt aktuell 6-Farbtechnologie. Für die statistische Spurenbewertung mit Hilfe des vollständig-kontinuierlichen Modells liefern wir eine bereits konfigurierte Auswertemethode EasyRead (LRfc) mit.

 

Size und Allel Calling

Für eine unkomplizierte und schnelle Analyse wurden die Size und Allel Calling Algorithmen der Rohdatenauswertung um eine automatische Peakerkennung mittels Polynomfunktion ergänzt. Des Weiteren wird die Größenzuweisung durch eine umfangreiche Mustererkennung unterstützt. Diese Verbesserungen ermöglichen eine effiziente Hochdurchsatzanalyse.  

Referenzdaten

GenoProof Mixture 3 unterstützt die automatische Analyse von autosomalen und gonosomalen Markern mittels kommerzieller Multiplex-Kits sowie mit In-house Multiplex-Kits. Die Basis dafür bildet eine umfangreiche Referenzdatenbank bestehend aus allen bekannten, kommerziell erhältlichen STR-Kits, Längenstandards und Markern. Zusätzlich kann diese Datenbank vom Nutzer ergänzt und erweitert werden.  

Grafische Benutzeroberfläche

Die Rohdaten werden in einer speziellen grafischen Benutzeroberfläche dargestellt, die extra für die Anzeige und Bearbeitung vom Elektropherogrammen entwickelt wurde. Neben einer punktgenauen Darstellung sowie umfangreichen Zoom-Funktionen bietet die Oberfläche auch viele Möglichkeiten für die Bearbeitung und Auswertung von Mischspuren. Dazu gehört auch die freie Anordnung mehrerer Fenster neben- oder übereinander, so dass mehrere Spuren direkt verglichen werden können. Für eine vereinfachte Analyse mehrerer Replikate wurde die Möglichkeit einer markerzentrischen Ansicht implementiert.  

Artefakterkennung

GenoProof Mixture 3 unterstützt die korrekte Rohdatenauswertung mit Hilfe von hochentwickelten Algorithmen zur Identifizierung von Sequenzierungs- und technischen Artefakten wie Stutter-Peaks, Shoulder-Peaks, Off-Ladder-Peaks und Off-Scale-Peaks. Die Artefakterkennung erfolgt automatisch während des Size und Allel Callings und kann vom Anwender angepasst werden. 

Ihr Ansprechpartner

Michael Kahr

Director Sales

  +49 351 8838 2808
  m.kahr@qualitype.de

Support

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